Luego llegaron "Tusk" (1978); "Santa Sangre"(1989); y "Rainbow Thief" (1990), protagonizada por Omar Sharif, Peter O'Toole y Christopher Lee. Su gran fracaso en el cine fue "Dune", basada en el libro de Frank Herbert, que iba a ser protagonizada por Orson Welles, Salvador Dalí (que pedía 100 mil dólares por hora de trabajo) y Gloria Swanson. Finalmente fue dirigida por David Lynch, con otro reparto.
Su cine llama especialmente la atención por ser impactante, transgresor, sobrecargado, extraño, con elementos esotéricos y con una atmósfera llena de simbolismos y surrealismo. Muchas veces tildadas de inentendibles, las películas de Jodorowsky tienen un lugar preferencial en el llamado "cine de culto".

